A Helyi Obszervatórium közvetlen célja a kormányzás átláthatóságának biztosítása, a területfejlesztési, térségfejlesztési, és településfejlesztési célok és eszközök, vagyis a gazdaság- és fejlesztéspolitika egészének hatékonyságjavítása érdekében olyan közérthető mutatószámok kialakítása, amelyekkel az egyes önkormányzatok és térségek munkája, valamint teljesítménye összehasonlíthatóvá válik. Mindemellett a Helyi Obszervatórium célja az is, hogy a gazdaságfejlesztés, a területfejlesztés számára a hazai és külföldi „jó gyakorlatokat” gyűjtse, és azokat konkrét viszonyokra adaptálja.A Helyi Obszervatórium hosszú távú célkitűzése, hogy az Európai Unió, és a kelet-közép-európai térség önkormányzati, és térségi folyamatait figyelő módszertani központjává váljon.